جوانب الاتفاق والاختلاف بين رحمت الله وفندر:
لابد عند المقارنة بين رحمت الله وفندر - مقارنة منهجية - في دراستهما للإسلام والمسيحية -أن نعتمد على أمور عدة هي (١):
١ - الهدف
اختلف الهدف عند كل منهما؛ فقد اعتمد فندر على إثارة الشبهات حول الدين الإسلامي، ودحض شبهات المسلمين - حول دين النصارى - ومحاولة تنصير أكبر عدد ممكن منهم. بينما اعتمد رحمت الله على صد القس فندر في محاولاته تشكيك المسلمين في دينهم، ورد تلك الشبهات ودحض افتراءاته، وإلزام فندر بالدين الصحيح، وتثبيت أفئدة المتزعزعين من عوام المسلمين ودحر محاولات التنصير.
٢ - المنهج
أنقد النصوص: تعرض كل منهما لنقد النص؛ سواء أكان النقد الداخلي للنص؛ من إثبات التناقض والتعارض، كما فعل رحمت الله، أونقد الإعجاز القرآني، كما فعل فندر.
ب الاحتجاج بالكتب: فقد احتج رحمت الله على النصارى، بما في كتبهم، وألزم خصمه بها، بينما ابتعد فندر على المنهج العلمي في الاحتجاج؛ لأنه لم يلتزم الشمول في العرض والدقة في النقل.
ت الاعتماد على المنهج التاريخي: فقد اعتمد رحمت الله على إثبات ضياع النسخ الأصلية من الإنجيل وفقدان السند المتصل، كذلك تحريف العقيدة الصحيحة في مجمع نيقية والانتصار لعقيدة التثليث. أما فندر فقد تعرض لقضية التواتر الكتابي للنص من خلال حرق الوثيقة الأصلية أو الوثائق الأخرى للقرآن على يد عثمان بن عفان بعد نسخ الأصل وتوزيعه على الأمصار.
ث المنهج المقارن: لجأ كل منهما إلى مقارنة الدينين الإسلامي والمسيحي معا وتفنيد الشبهات وردها بالعقل أو بالنقل أو بكليهما.
٣ - المصادر: اعتمد رحمت الله على الكتاب والسنة وفهم السلف الصالح في الإسلام وعلى علماء النصارى المعتمدين لديهم في المسيحية، بينما اعتمد فندر على رأيه من خلال بعض التفاسير للقرآن والحديث وبعض المقولات الشاذة الغير مثتبة في الإسلام وعلى آرائه وتحليلاته من خلال نص الكتاب المقدس في المسيحية.
٤ - الدقة العلمية: لم يعتمد فندر الدقة العلمية في نسبة النصوص إلى أصحابها كذلك بعض آيات القرآن الكريم، وعدم نقل بعض التفسيرات كاملة لأصحابها، وفي مواضعها اللازمة، بينما كان رحمت الله يتحرى النقل في الأقوال - من الجانبين - الإسلامي والمسيحي - بدقة بالغة.
أما من حيث جوانب الاتفاق والاختلاف بينهما، فشملت الكتب والقضايا المثارة من خلال تلك الكتب أو المناظرة.