مع كل أعداء الوحدة، أمثال طه حسين الذي نشر مقالاً في مجلة المكشوف يدعو فيه إلى استقلالية شخصية مصر وفرعونيتها المتأصلة و"أن الأكثرية الساحقة من المصريين لا تمت بصلة إلى الدم العربي، بل تتصل مباشرة بالمصريين القدماء" (يراجع في هذا وحواره مع طه حسين كتابه: حوار وأسرار ص ٥٣).
وعندما تأسست منظمة التحرير الفلسطينية، سنة ١٩٦٤، كان أول رئيس لهذه المنظمة. وأنشأ جيش التحرير الفلسطيني، فتألفت الكتائب الفلسطينية، ثم الألوية، ثم أنشأ قوة فدائية باسم (قوات التحرير الشعبية) قامت بعمليات ناجحة في كل الأراضي الفلسطينية المحتلة، وبقي فيها حتى ٢٤/ ١٢/١٩٦٧ م.
قلت: وصدر فيه كتاب بعنوان: الشقيري في الميزان/اميل الغوري. - بيروت.