مؤلفاته: للمؤلف كتب كثيرة. بلغات مختلفة في علوم متنوعة. ولقد ذكر المؤلف في ترجمته لنفسه في " أبجد العلوم " (٣ / ٢٧٥ - ٢٧٩) مصنفاته إلى تاريخه والذي يعنينا هنا ما كان باللغة العربية ولقد ذكر الدكتور جميل أحمد في كتابه " حركة التأليف باللغة العربية في الإقليم الشرقي الهندي في القرنين الثامن عشر والتاسع عشر للميلاد " (ص ٢٧٤ - ٢٨١) مؤلفات محمد صديق حسن خان وجعلها في ثلاث زمر:
١ - ما طبع ونشر.
٢ - ما لا يزال مخطوطًا.
٣ - ما كان مجهولًا، وقف على اسمه في كتب القِنَّوْجِي الأخرى، أو في غيرها من الكتب.
أما الكتب التي طبعت فهي (١) ١ - فتح البيان في مقاصد القرآن: المطبعة الكبرى الأميرية بالقاهرة: ١٣٠٠ - ١٣٠٢ هـ (في عشرة أجزاء) ، الطبعة الأولى ببهوبال.
٢ - نيل المرام من تفسير آيات الأحكام: لكهنو ١٣٩٢ هـ مطبعة المدني بمصر ١٣٨٢ هـ / ١٩٦٢ م.
٣ - الدين الخالص (جمع فيه آيات التوحيد الواردة في القرآن، ولم يغادر آية منها إلا أتى عليها بالبيان الوافي) : دهلي - مطبعة المدني بمصر - ١٣٧٩ هـ / ١٩٥٩ م.
٤ - حسن الأسوة بما ثبت عن الله ورسوله في النسوة: الجوائب ١٣٠١ هـ.