يمول المركز من وسائل دخل على صورة هبات أو ما شابه ذلك، وتوضع الأموال في حساب في المصرف باسم المركز الثقافي الإسلامي ويتم الصرف عن طريق توقيع مشترك من الرئيس وأمين الصندوق في المبالغ التي لا تزيد عن عشرة آلاف كرون دانمركي.
يقوم رئيس اللجنة الشرفية بإبلاغ المصرف في حالة تغيير الرئيس أو أمين الصندوق أو غياب أحدهما.
تُعد اللجنة العاملة الميزانية ويقوم أمين الصندوق بعمل الحسابات ويتم مراجعتها بواسطة محاسب قانوني.
٦- أملاك المركز
بما في ذلك الأموال العقارية تعتبر وقفا إسلاميا، وفي حالة حل المركز تصبح وقفا إسلاميا تؤول إدارته إلى الحرم المكي الشريف.
يجب توقيع الرئيس وأمين الصندوق مجتمعين في حالة شراء أو بيع أو رهن العقارات إن وجدت بموافقة اللجنة الشرفية.
تمت مناقشة هذا النظام وإقراره في الاجتماع الذي عقد بمنزل السفير المغربي بكوبنهاجن مساء يوم ٢١ رمضان ١٣٩١هـ الموافق ٩ نوفمبر ١٩٧١م.