وقال خلفٌ: سمعت أبا عمرو الخفاف يقول: نا محمد بن إسماعيل التقي النقي العالم الذي لم أر مثله.
وروي عن محمد بن أبي حاتمٍ قال: سمعت علي بن حجرٍ قال: أخرجت خراسان ثلاثةً: أبا زرعة الرازي بالري، ومحمد بن إسماعيل البخاري ببخارى، وعبد الله بن عبد الرحمن السمرقندي بسمرقند، ومحمد بن إسماعيل عندي أبصرهم وأعلمهم وأفقههم.
وروي عن عبد الله بن عبد الرحمن السمرقندي قال: قد رأيت العلماء بالحرمين والحجاز والشام والعراقين، فما رأيت فيهم أجمع من أبي عبد الله محمد بن إسماعيل البخاري.
وروي عن الحسين بن محمد المعروف بعبيد العجل قال: ما رأيت مثل محمد بن إسماعيل، ومسلم الحافظ لم يكن يبلغ محمد بن إسماعيل، ورأيت أبا زرعة وأبا حاتمٍ يستمعان إلى محمد بن إسماعيل أي شيء يقول، يجلسان إلى جنبه. فذكر له قصة محمد بن يحيى، فقال: ماله ولمحمد بن إسماعيل؟ كان محمد بن إسماعيل أمةً من الأمم، وكان أعلم من محمد بن يحيى بكذا وكذا، وكان محمد بن إسماعيل