توفي بالقاهرة في ١٣ رجب ١٣٧٧ هـ وفق ٢ شباط (فبراير) ١٩٥٨ م. وحضر تشييع جنازته كبار رجال الدولة، وعدد من علماء الشرق، ودفن في المقبرة التيمورية بوصية منه، حذو صديقه العلامة أحمد تيمور.
* المراجع:
- "الأعلام" (٦/ ١١٤)، خير الدين الزركلي.
- "أعلام الإسلام" (٢٦٩)، محمد سعيد الطناوي.
- "أعلام الفكر الإسلامي" (٣٧٨ - ٣٨١)، أحمد تيمور.
- "تاريخ المجمع العلمي العربي" أحمد الفتيح.
- مجلة "مجمع اللغة العربية" (٥/ ٥٠، ٣٩٦، ٥٦٩ - ٦/ ٥٧٧ - ٧/ ٢، ٤٧٥ - ٨/ ٤١٠ - ٩/ ٩ - ٣٣/ ٣٣٦ - ٣٣٨ - ١٥/ ٢٨٥).
- "مجمع اللغة العربية في ثلاثين عاماً"، مهدي علّام.
- "محاضرات المجمع العلمي العربي".
- "محمد الخضر حسين" (سلسلة أعلامنا)، أبو القاسم محمد كرو.
- "محمد الخضر حسين: حياته وآثاره"، محمد مواعدة.
- "معجم المؤلفين" (٩/ ٢٧٩ - ١٣/ ٤١٨)، محمد رضا كحالة.
- "المعجم الوجيز للمستجيز".
- "ملف الشيخ محمد الخضر حسين في المجمع العلمي العربي بدمشق".
- "يوم ميسلون"، ساطع الحصري.