هـ؛ رقم ٥٣٨٣؛ ٥٢٣٥؛ ٥٣٢٤؛ مدرسة غرب همدان ٧٩١؛ آستان قدس رضوي ٢٤، ١٠٩٣ هـ؛ رقم ١٢٤٢٠ , ١١٠٥ هـ؛ رقم ٥٦٤٨، ١١٠٧ هـ؛ رقم ٧٥٨٤، ١١٢٢ هـ؛ رقم ٤٩٢ , ٤٩٣ , ٤٩٤؛ طبعت في Istanbul ١٢٩٠/ ١٨٧٣؛
٦ - حاشية على شرح هداية الحكمة - في المنطق
قيصري راشد أفندي ٨٢٩/ ٩ ورقة ٧٣ - ٨٨؛
٧ - حاشية على لوامع الأسرار في شرح مطالع الأنوار - في المنطق
قيصري راشد أفندي ٨٢٩/ ١ ورقة ٤٠؛ المكتبة القادريّة ٨٢٩ ورقة ١٢٩؛ ١١٢٥ هـ؛ مكتبة الأوقاف العامّة ١٣٥٢٩ ورقة ٨٠؛ ١٠٧٣ هـ؛ آية الله نجفى ٣٩/ ٣ ورقة ١٩٠ - ٢٤٨، ١٠٥٤ هـ؛ رقم ٥١٤٧ ورقة ١٦٨، ١١١٨ هـ؛ رقم ٥١٥٩/ ٢ ورقة ٥١ - ١٠٢ كتبت في عصر المؤلّف؛ رضوي ٩٩٣؛ ٩٩٢؛
٨ - حاشية على مختصر المعاني في شرح تلخيص المفتاح
قيصري راشد أفندي ٨٢٩/ ١٠ ورقة ٨٩ - ١٢٨؛ ١٠٨٩ هـ؛ إزمير ملّي ٢٨٦ ورقة ٧٠؛ ١٠٦٧ هـ؛ المكتبة الأحمديّة= خزانة جامع الزيتونة بتونس معاني بيان ٤٣٨٢ ورقة ٦٣، ١٠٠٦ هـ؛
٩ - حاشية على المطول في شرح تلخيص المفتاح
أحمد ثالث ورقة ١٦٨١ ورقة ١٨٦؛ مكتبة الأوقاف العامّة ١٢٢٧٤ ورقة ٩٣؛ ١١٥١ هـ؛ عموجه زاده ٣٨٦ ورقة ٢١٢؛ المكتبة العباسية بالبصرة رقم ١٥/ ب صفحة ٤٣٤، ١٢٩٧ هـ؛
١٠ - حاشية على شرح مختصر المنتهي لإبن الحاجب
كوريلي ٤٨٩/ ١ ورقة ١٤٢؛ مكتبة الأوقاف العامّة ٣٥١٦؛ ٤٣٢٨؛ ٥٣٥٤؛ ٥٣٨٦؛ ٥٣٦٩؛ ٩٧١٨؛ ٩٧١٩؛ ٩٧٢٠؛ ٥٠٥٧؛ المكتبة القادريّة ٥٠٩ ورقة ٢٧٤؛ ١٠٦٨ هـ؛ تبريز تربيت ٩٧, ١٠٦٦ هـ؛ مدرسة غرب همدان ٨٠٩/ ١ , ١١٠٧ هـ؛ الخزانة التيموريّة فنّ الأصول ١٣٤, ١٠٩٩ هـ؛ آستان قدس رضوي ٢٩٧٥، ١٠٤٣ هـ؛ رقم ١١٤٨٩، ١٠٨٨ هـ؛ رقم ٦٨٦٥ , ١٠٦٣٦؛
١١ - حاشية على شرح إثبات الواجب - في الكلام
تاريخ التأليف ٩٨٣ هـ؛ قيصري راشد أفندي ٤٦٩/ ٣؛ ٤٩٠/ ٢؛ ٨٧٨/ ٤؛ ١٤١٦/ ٣؛ قره حصار ١٧٨٥١/ ٣ ورقة ٥٣ - ١١٢؛ ١٠٦٨ هـ؛ رقم ١٧٦٠١؛ ديانت ٦٥٨/ ٣؛ ٦٣٠/ ١؛ ألمالي ٢٧٧٠/ ٢ ورقة ٤٠ - ١٢٩؛ ١١٠٤ هـ؛ آقسكي ٢٢٦ ورقة ٦٩؛ ١٠٧٦ هـ؛ آماسيه ٥٥١/ ٢؛ ٥٤٦/ ١؛ ٩٠٧؛ ٩٢٠/ ٦؛ ١٠٩١/ ٣؛ مكتبة الأوقاف العامّة ٥٣٠٩/ ٤ ورقة ٦٢؛ ١٢٢٦ هـ؛ رقم ١٣٧٩٥؛ ٥٣١٤/ ٣؛ ٥٣١٤/ ٣؛ ٥٢٩٣/ ٣؛ ٥٢٢٤/ ٣؛ ١٣٧٩٥/ ٢؛ ٢٣١٨٢؛ ٥٠٦٧/ ٢؛ المكتبة القادريّة ١٥١٣؛ جامعة الرياض ٩٣٦٤/ ٢ ورقة ٧٥ - ١٤٢؛ محمود ثاني ٨٢٠/ ٢ ورقة ٦٩؛ ١١٢١ هـ؛ Ahlwardt ٢٣٣٣؛ القاهرة ملحق ٢١٨٤٤/ ب مجموعة ورقة ٧ - ٢٥ , ١٠١٥ هـ؛ آستان قدس رضوي ٤٢٣، ٩٨٩ هـ؛ رقم ٩٦٥٥، ١٠٩٧ هـ؛ رقم ٥٨٧١ , ١١٠٦ هـ؛ رقم ١١٠٩٣، ١١٠٧ هـ؛ رقم ٤٢٥، ٦٨٦٤، ٧٩، ٨٦؛ خزائن مدرسة الخيّاط بالموصل عقائد ٤/ ١ ورقة ٤٠، ١١٣٢ هـ؛
١٢ - حاشية على شرح المواقف - في الكلام
آستان قدس رضوي رقم ٤٧٩؛
١٣ - حاشية على شرح حكمة العين - في المنطق
قيصري راشد أفندي ٦٢٣/ ٢؛ ٨٣٥/ ٢؛ ٨٥١/ ٣؛ ٨٧٨/ ٢؛ ٩٣٣١/ ١؛ أحمد ثالث ٣٢٨٣ ورقة ١٠٤؛ رقم ٣١٩٦ ورقة ١٣٨؛ إزمير ملّي ٨٨٥/ ٤ ورقة ٦٣ - ١٤٧؛ ١٠٩٧ هـ؛ رقم ١٦٦٥ ورقة ٩٩؛ مكتبة الأوقاف العامّة ٥٣١٥؛ ٥٣٧٣؛ ٥٢٧٢؛ ٥٢١٨؛ ٦٤٦٨؛ ٥٢٦٢/ ٣؛ ١٢٢٠٠؛ كوبريلي ٨٦٦ ورقة ٧٣؛