وله على الكتاب هوامش مفيدة، فيها نقولات نفيسة عن العلماء، وفي بعضها ترجيح وذكر اختيار لبعض المحققين من علماء المذهب (انظر -على سبيل المثال- ١/ ٤١، ٤٢، ٦٤، ٦٥، ١٢٣، ١٢٨، ٥١٠، ٥١١)، وفي بعضها تعقّب للمصنف، وفي بعضها مزيد توضيح لعبارة غامضة أو بيان لمبهم. وهكذا (انظر -على سبيل المثال- ١/ ٦٣، ٩٢، ٩٤، ١١٦، ١١٧، ١١٨، ١١٩، ١٢١، ١٢٧، ١٢٨، ١٣٦، ٣٨٩ و ٢/ ٢٣، ١٠٨)
وهذه النسخة مضبوطة، وعلى هوامشها تصحيحات وإلحاقات.
وفي آخرها كلام فيه مدح وثناء لكتاب "تقرير القواعد وتحرير الفوائد" بخط متأخّرٍ مغاير لخطِّ النَّاسخ، فلعله بخط بعض متملّكيها، ولعل الناسخ قد كتب هذا الكتاب بالأجرة، كما ذكر في ترجمته (١).
الثالثة: ورمزت لها بحرف (ج).
وهذه النسخة من محفوظات مكتبة الرياض العامة، تحت رقم (٤٣١/ ٨٦) وتقع في (٢١٨) ورقة، وفي بدايتها "فهرست تقرير القواعد".
وفي أولها: "بِسْمِ اللَّهِ الرَّحْمَنِ الرَّحِيمِ. ربِّ يسِّر وأعن يا كريم. اللهم عونًا منك، فالمعان نريد.
قال الشيخ الإمام العلامة، والبحر الفهامة: أبو الفرج زين الدين عبد الرحمن بن أحمد بن رجب الحنبلي البغدادي رحمه اللَّه تعالى ورضي عنه:
الحمد للَّه الذي مهد قواعد الدين بكتابه المحكم. . . ".