- المكتبة الكتانية [١٣٩٨] (ج ١: ٢٤٢ ورقة، مضطربة الأوراق، كتبت سنة ٧٧٢ هـ).
- طوبقبو سراي [M.٤٤٤٦٠٢٣] (ج ٢: ٢٦٨ ورقة، كتبت سنة ٧٧٦ هـ، أولها: «فصل في مبدأ الهجرة التي فرَّق الله فيها بين أوليائه وأعدائه ... »). انظر فهرسها (٣/ ٤٢٤).
- مكتبة الأوقاف ببغداد [١٧٩٨٩] (ج ١: ٢١٦ ورقة، كتبت سنة ٧٩٠ هـ).
- تشستربيتي [٣٥٤٢] (جـ ٣: ٢٢٢ ورقة، بخط نسخي ممتاز، من القرن الثامن).
- مغنيسا [١٧٩٢] (ج ١: ٣١٩ ورقة، كتبت سنة ٨١٣ هـ).
- دار الكتب المصرية: مجاميع مصطفى فاضل [٢٢٩] (ق ١ - ١٧٧، كتبت سنة ٨٣٤ هـ).
- طوبقبو سراي [M.٤٤٥٦٠٢٤] (ج ٣: ٢٣٠ ورقة، كتبت سنة ٨٤٠ هـ، أولها: «قلت: في هذه القصة نظر، فقد ذكر أبو حاتم ابن حبان في صحيحه وغيره وفاته عن مجاهد عن إبراهيم بن الأشتر ... »). انظر فهرسها (٣/ ٤٢٤).
- الظاهرية بدمشق [١٨٩٧، ١٨٩٨] (ج ٢: ٢٠٨ ورقة، ج ٣: ٢٤٤ ورقة، كتبت سنة ٨٥٣ و ٨٥٤ هـ).
- ليدن [٢٩٩٨ شرقيات] (مج ٣: ٢١٤ ورقة، كتبت سنة ٨٥٤ هـ). انظر فهرسها ص ٤٠٣.
- الخزانة العامة بالرباط (نسخة كاملة في مجلدين، ج ١: ٢٢٧ ورقة، ج ٢: ٢٧٢ ورقة، بخط محمود بن علي الهندي المتوفى سنة ٨٦٥ هـ).