الشيخ بعد كونه رئيسا مستقلا للجامعة هو إجراء التوسعة في هذا المسجد، كما انتهى بناء مبنى دار الحديث (الدور الأرضي) عام ١٣٤٩ هـ، وقد كان الشروع في بناءه منذ عام ١٣٣٣ هـ، وكذلك بدئ في بناء دار الحديث (الدور الأول) عام ١٣٥٢ هـ حسب القرار والتصميم، الذين كانت الموافقة قد صدرت عليهما من قبل مجلس الشورى بالجامعة عام ١٣٢٥ هـ، واستكمل بنائه في ظرف سنوات عام ١٣٥٥ هـ.
وأيضًا تم عام ١٣٥٦ هـ إنشاء مبنى القسم الفارسي باسم "يادكار سعدي" ذكرى الشيخ سعدي الشيرازي، صاحب كتاب "كلستان" و"بوستان"، الشهيرين في العالم المتوفى ٦٩٠ هـ، وكذلك تم في هذا العام نفسه بناء مبنى ذي طابقين لقسم صيانة الوثائق الجامعية، يقع في الجانب الجنوبي من مكتب رئيس الجامعة، ثم تحقّق تنفيذ مشروع مبنى دار التفسير عام ١٣٥٨ هـ، وذلك على الدور الثاني من دار الحديث، وشيّد سقف هذا المبنى بشكل قبّة جميلة، تزين المباني الجامعية كلّها، وكأنها تاج جميل على رأس هذه المباني.
كما تم تنفيذ مشروع بوّابة، (ظاهر) عام ١٣٥٩ هـ، وذلك على نفقة الملك الأفغاني ظاهر شاه، قدّمها إلى رئيس الجامعة لدى زيارته لـ "أفغانستان"، وهي بوّابة ضخمة، تضمّ عددا من الغرف الصغيرة والكبيرة، كما تم في عام ١٣٦٠ هـ استكمال بناء غرفة من السكن الجامعي الكبير، المعروف باسم "الدار الجديدة"، الذي كان مشروعه يضمّ (٥٢) غرفة، وقد سبق أن تم بناء خمس غرف منها في الجانب الشمالي الغربي على عهد رئيس الجامعة السابق الشيخ الحافظ محمد أحمد، والد الشيخ محمد طيّب.
وكذلك أنشئ عام ١٣٦٧ هـ مبنى مستقل لقسم الإفتاء باسم دار الإفتاء، وذلك في الطابق الثاني من الجانب الشرقي من مسجد دار العلوم القديم، وتم نقل هذا القسم إليه يوم ١٩ ربيع الثاني ١٣٦٧ هـ.